吴元济率军返回开罗时，朝廷的圣旨早已到了，交给了留守开罗的副将郁景斌手里。
圣旨里明确，吴元济提升为从三品的穆庭路代总督，镇东军其他将领不动，全军驻扎在开罗一带，作为第三波进攻的兵力。穆庭路目前辖区范围为埃及、叙利亚、亚美尼亚三地，划为6个郡，待第三波征服行动以后，再进一步扩大。
圣旨里还要求，吴元济要兼管开罗造船和修建苏伊士运河事宜，统筹调配穆庭路的力量，确保两个项目顺利开展，开罗造出来的战船，全部供镇东军后续在地中海作战使用。
既然是在开罗改造新造的战船都归镇东军使用，吴元济顿时来了精神，派人在埃及、叙利亚的沿海一带搜集了不少体型较大的战船、商船，集中在亚历山大港，在尼罗河搜集的船只则直接弄到开罗。
每年的夏季前后四五个月，是尼罗河水泛滥的时候，这时候，是尼罗河三角洲一带可以通行大船的时候。吴元济就利用这个时候，将新建、改造好的战船开到亚历山大，将其他地方弄来的船只开到开罗造船厂。
这样来回倒腾，也是没有办法的事，一个苏伊士地峡就隔开了两个大洋，这边的船只过不去，只能采取折衷的办法倒腾新船。颜玮带着一帮造船专家和工人，虽然紧锣密鼓的赶工，但是镇东军起码要上百艘战船，造出来谈何容易。
一部分战船，在当地寻找木料拉过来，按照标准打造，然后再包上铁皮，装上蒸汽动力和火炮，但是这样造船速度慢，大部分战船是将已有的船体直接改造，装上蒸汽动力和火炮。
第一种自然更加坚固，抗打击能力强，但是数量少，第二种也有蒸汽动力和火力，但是抗打击能力差点，占大多数。
这些战船造好以后，先集中停放，待到尼罗河上游到了雨季，河水上涨，再开到亚历山大，镇东军的水兵再上船熟悉一番，就可以使用。
另一个工程更加浩大，在訾臻韬的指挥下，十多万战俘开始大规模开挖苏伊士运河，刚开始有两个羌戎团担任监工，后面吴元济干脆将开罗那个团也调过去，共三个团监工。
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